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Quoi de neuf scientifiques Barcoding aspirent à adhérer aux objectifs de la Convention sur la diversité biologique en favorisant la conservation, la durabilité et le partage équitable des avantages découlant de l'utilisation des ressources génétiques. CONTEXTE: En dépit des quantités apparemment abondantes de variation observable et la diversité des espèces, l'ordre des lépidoptères présente une homogénéité morphologique qui a fourni un nombre limité de caractères taxonomiques et a conduit à l'utilisation généralisée de nucléotides pour inférer des relations. Cette étude vise à caractériser et développer des méthodes pour quantifier la valeur des régions de gènes prioritaires désignés pour la systématique moléculaire lépidoptères. En particulier, j'évalue la façon dont le segment d'ADN code-barres du gène mitochondrial COI effectue dans un large éventail temporel donné sa position de numéro un de priorité, statut le plus séquencée, et les opinions contradictoires sur sa performance phylogénétique. METHODOLOGIE / Constatations principales: régions de gènes couramment séquencés pour phylogénétique de lépidoptères ont été marqués en utilisant de multiples mesures dans trois catégories: l'aspect pratique, qui comprend l'universalité des amorces et de la qualité de la séquence; utilitaire phylogénétique; et le signal phylogénétique. Je trouve que les mesures de rechange dans une catégorie apparaît souvent corrélées, mais des scores élevés dans une catégorie ne se traduisent pas nécessairement des scores élevés dans une autre. Le code à barres de l'ADN a été plus facile à la séquence que d'autres gènes, et avaient des scores élevés pour l'utilité, mais faible signal supérieur au niveau du genre. CONCLUSIONS / IMPORTANCE: Compte tenu des ressources financières limitées et des contraintes de temps, une sélection rigoureuse des régions de gènes pour phylogénie moléculaire est cruciale pour éviter un gaspillage d'efforts à produire des données partiellement informatifs. Cette étude présente une approche pour évaluer la valeur des régions de gène avant l'initiation de nouvelles études et présente les résultats empiriques pour aider à guider les sélections futures. Les capuchinos sont un groupe d'oiseaux du genre Sporophila qui a apparemment rayonnée récemment, comme en témoigne leur manque de diversité génétique mitochondrial. Nous avons obtenu la cytochrome c oxydase I (COI) des séquences (ou des codes à barres de l'ADN) pour les 11 espèces du groupe et divers outgroups. Nous avons comparé les modèles de COI variabilité des capuchinos avec ceux des énoncés des oiseaux néotropicaux actuellement disponibles les plus grandes données de codes à barres (500 espèces représentant 51% de la richesse aviaire en Argentine), et séquences COI soumis à neighbor-joining, la parcimonie maximale et phylogénétique bayésienne analyses ainsi que l'analyse statistique de réseau de parcimonie. Un clade dans les capuchinos, les capuchinos du Sud, a montré intraspécifique supérieur et de divergence interspécifique plus faible que les espèces argentines restantes. Comme la plupart des capuchinos sud partagé haplotypes COI et les distances appariées au sein des espèces étaient dans de nombreux cas plus élevé que les distances entre eux, les affinités phylogénétiques au sein du groupe sont restées en suspens. Le modèle génétique observée est conforme à la fois la lignée incomplète de tri et de flux de gènes entre les espèces. Les capuchinos du sud constituent le seul grand groupe d'espèces parmi les oiseaux néotropicaux jusqu'à présent code-barres qui sont inséparables lors de l'utilisation des codes à barres de l'ADN, et l'un des rares multispécifique groupes aviaires connus manquent monophylie réciproque. L'extension de l'analyse à l'évolution rapide nucléaire et marqueurs mitochondriaux sera cruciale pour la compréhension de ce rayonnement. En plus de donner un aperçu de l'évolution des capuchinos, cette étude montre comment l'ADN barcoding peut espèces ou groupes d'espèces dignes d'une étude plus approfondie rapidement drapeau. Au cours de vastes campagnes en cours pour les mites d'inventaire de l'Amérique du Nord et la région de Conservacion Guanacaste (ACG), le nord-ouest du Costa Rica, nous avons découvert que les papillons yponomeutid morphologiquement similaires ont été assignés deux noms différents, Atteva ergatica Walsingham au Costa Rica et A. punctella (Stoll) dans Amérique du Nord, mais il y avait des codes à barres d'ADN identiques. La combinaison de l'ADN barcoding, morphologie et végétales alimentaires dossiers ont également révélé un complexe de deux espèces sympatriques qui sont diagnosticables par leurs codes à barres ADN et leurs facies au Costa Rica. Cependant, ni les noms pourraient être correctement appliqué à ces deux espèces, comme A. ergatica est un synonyme junior et A. punctella un homonyme. En reliant nos échantillons à saisir la matière à travers la morphologie et l'ADN barcoding, nous avons déterminé que les espèces forestières sèches ACG, distribuées du Costa Rica au sud du Québec et de l'Ontario, devraient être appelés A. aurea, alors que les espèces similaires et marginalement sympatriques forêt tropicale ACG trouvé en Amérique centrale devrait être appelé A. pustulella. Neotypes sont désignés pour Phalaena Tinea punctella Stoll, 1781 et Deiopeia aurea Fitch, 1857. Atteva floridana a des codes à barres identiques à A. aurea et provisoirement maintenue comme synonyme. Des études antérieures ont établi que l'extrémité 5 'de la COI du gène mitochondrial (cytochrome oxydase sous-unité I) est utile pour l'identification rapide et fiable des espèces d'algues rouges et ont démontré que notre compréhension de la biodiversité des algues rouges et biogéographie est fragmentaire. Dans ce contexte, nous achevons un échantillonnage complet le long de la côte canadienne et en utilisant le code à barres de l'ADN pour l'attribution des collections pour les espèces génétiques pour explorer la diversité d'algues dans la flore canadienne. Dans la présente étude, nous fournissons des résultats en ce qui concerne la diversité des membres de la famille d'algues rouges Phyllophoraceae. Nous avons analysé 354 personnes des côtes de l'Arctique, de l'Atlantique et du Pacifique du Canada, ainsi que 26 spécimens des États-Unis, en Europe et en Australie, la résolution 29 espèces sur la base des analyses du code à barres de l'ADN. Vingt-trois de ces espèces génétiques étaient présents au Canada, où seulement 18 espèces sont actuellement reconnues, y compris Ceratocolax hartzii Rosenv. qui était dans le même groupe d'espèces génétiques comme truncatus de Coccotylus hôte (Pall.) M. J. Wynne et N. J. Heine et est ainsi transféré à Coccotylus, C. hartzii (Rosenv.) peigne. nov. mais conservé comme une espèce distincte en raison de son habitude unique et la phénologie. Nos résultats ont révélé la présence de la diversité cryptique au sein des genres Coccotylus, Mastocarpus, Ozophora et Stenogramme, pour lequel nous ressuscitons Coccotylus brodiei (Turner) K et Stenogramme cf. rhodymenioides Joly et Alveal, auparavant uniquement connu de l'Amérique du Sud. Enfin, les affinités phylogénétiques des espèces canadiennes de Phyllophoraceae caractérisées dans cette étude ont été étudiés en utilisant LSU ADNr, RUBISCO LSU (rbcL), et analyses combinées. Calendrier des événements